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依所得稅法規定，扣繳義務人於「給付」薪資時，應依規定之扣繳率扣取稅款。所稱給付時，依同稅法施行細則第82條規定，係指實際給付、轉帳給付或匯撥給付之時。
公司給付員工薪資，若屬預付，以借支方式列帳，則預付時不用扣繳稅款，但該員工薪資屆期時，即應予以沖正，並依規定扣繳率扣繳稅款，如屆期未予沖正並扣繳稅款，稽徵機關將依所得稅法第114條規定，除責令賠繳稅款外，另處1倍至3倍罰鍰；另年度結束時，公司採權責基礎制，將應付員工之薪資及獎金以應付費用列帳而尚未轉入該員工帳戶者，既尚未給付，則免扣繳稅款，於實際給付時再辦理扣繳稅款即可。
扣繳義務人應注意相關扣繳規定，以免因漏未扣繳而受
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